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在职员工注册个体户，对于社保有一定的影响，但具体影响取决于多种因素。
需要明确的是，在职员工注册个体户后，其社保缴纳方式和缴纳标准可能会发生变化，根据相关法律规定，个体户需要为员工缴纳社会保险费用，如果个体户在职员工已经在原单位参加了社保并缴纳了一定的社保费用，那么在注册个体户后，其社保缴纳可能会受到影响，需要根据当地的政策和规定来确定是否需要重新开户缴纳社会保险费用，以及是否需要办理社保转移手续等。
对于个体户的经营情况也会影响社保缴纳，如果个体户的经营状况良好，能够为其员工提供正常的社保缴纳，那么在职员工的社保待遇不会受到太大影响，但如果个体户经营状况不佳，无法为其员工正常缴纳社保费用，那么在职员工的社保待遇可能会受到影响。
还需要考虑其他因素，如劳动合同、税务等方面的影响，如果个体户与员工签订了劳动合同并按照法律规定为员工缴纳社保费用，那么在法律层面上是合法的，但如果个体户存在违规行为，如未签订劳动合同或未按规定缴纳社保费用等，将会受到法律制裁并可能影响员工的社保权益。
在职员工注册个体户对社保有一定的影响，但具体影响取决于多种因素，建议在职员工在注册个体户前咨询当地相关部门或专业人士的意见，并了解相关政策和规定。